一、数据库 

用友T3：MS-SQLSERVER大型数据库，海量数据，可以支持无限站点使用。

金蝶KIS：采用OFFICE 自带的ACCESS小型数据库，超过三站点软件使用不很稳定，单个账套数据量有限制，账套数据多了就不稳定。

ACCESS在非正常操作下很容易损坏，也很容易崩溃。而SQL数据库容量大，稳定性好。

二、网络版 

用友T3：支持网络用户不限站点安装、操作、查询；网络版可以不限制网络电脑安装台数，如网络三站点可以安装三台以上机器使用，操作、查询，如1、2、3台机器同时在使用总账系统，其他机器可以操作、查询报表、固定资产等其他模块网络版站点受站点数限制，账套中所有模块可以支持不同时间启用，模块之间有紧密关联、也可以单独使用，可以不关联 

金蝶KIS：只能安装网络站点数机器操作、查询，所有模快必须在同一时间启用，模块之间有先后次序，如固定资产不结账不能进行总账系统的结账；迷你单机版可以组合成网络版欺骗客户，但实际标准版网络版站点不宜超过3站点 

三、凭证处理 

用友T3：制作凭证任意分录自动平衡功能 金蝶凭证只支持借贷两行分录平衡；用友T3全面支持键盘操作，金蝶很多地方需要鼠标辅助；用友T3有凭证作废功能，金蝶无；用友凭证删除后可以整理断号，金蝶删除后凭证号间断；用友T3可以一边制作凭证分录一边就可以联查到相关分录的明细账和余额， 金蝶不可以；用友T3在填制凭证时可以模糊过滤相应科目、部门、个人、供应商、客户等信息，金蝶不可以；  

四、报表处理 

用友T3提供10余个重点行业的标准财务报表模板，包括最新的《现金流量表》，可轻松生成复杂报表。提供自定义模板的新功能,可以根据本单位的实际需要定制报表模板。 

金蝶无任何行业报表模版 

用友的可以每月单独生成多张报表，金蝶的全年就一张报表，里面通过日期调整重新计算，很不方便。

用友的报表可以任意导出到EXCEL，并且保持格式不变；金蝶的无法原样导出。

五、数据处理： 

用友T3提供了排序、审核、舍位平衡、汇总功能 金蝶在这方面功能很弱 

六、图表处理： 

用友T3采用“图文混排”，可以很方便地进行图形数据组织 金蝶无；T3可以按月提供帐龄分析 ，金蝶没有这方面的功能 

七、初始设置： 

用友T3启用后，可以通过反结账功能反到启用的月份，就可以修改期初数据，且不会对日常数据造成任何影响；

金蝶则必须进行结束初始化工作且结束后不能修改期初数据，如想反初始化则将删除和取消所有日常处理 

用友T3可以随时修改以前年度的期初数，可以重新结转上年数据，而金蝶则没有此功能。

八、应收应付

单据批处理：用友T3直接可以在单据列表中通过全选/全消或者手工选择单据进行批量审/批量弃审处理，且能出来一个相应的审核/弃审报告；金蝶的单据的批量审核/弃审处理不太灵活好用 

用友T3提供明细的栏目设置、栏目排序、修改栏目名称的功能 金蝶的单据列表不能进行栏目设置 

用友T3可以处理一笔收款中核销一部分，一部分形成预收款的情况 金蝶不能处理一笔结算金额中部分核销部分形成预收款的情况 

用友T3可以输入查询的范围，且可以选择查询对象和明细对象，两者可以形成组合，行成展开和汇总的查询格式 金蝶的应收/付明细账不能一次查询多个客户/供应商无法提供按查询对象进行连续分页打印功能无提供两种查询对象的组合查询 

九、安全性

用友有数据自动备份功能，设置好备份时间，电脑会自动按时帮你把数据备份到其他盘上；金蝶的没有自动备份功能。所以在安全性上，用友做的非常好。

十、数据分库处理

金蝶把所有数据不管多少年都放在一个数据库里，一个年度的数据坏了，整个数据库就坏了，用友的数据是分年度存放的，即每个年度创建一个数据库。假如一个年度数据坏了，其他年度的不会受影响，安全性和稳定性很高。

以上比较，仅作参考!